בניגוד לרואי החשבון החיצוניים המבקר הפנימי משרת בראש ובראשונה את הדירקטוריון ואת ההנהלה הפעילה. משום כך הוא אינו מתיימר, ואף אינו מקיים בפועל, את התנאי הבסיסי של אי תלות שהוא תנאי יסודי החייב להתקיים באופן מוצהר, לגבי רואה החשבון החיצוני
(להרחבה ראה מעות)אנגלית: controllers independence